Ion Storm era al lavoro su Deus Ex 3 prima di chiudere
Due possibili trame erano pronte per il nuovo capitolo.
Quando Ion Storm chiuse i battenti nel 2005, gli autori dei primi due capitoli di Deus Ex erano al lavoro su un terzo episodio: la rivelazione, riportata da Gamingbolt, arriva da Joe Martin all'evento VideoBrains.
Prima che arrivasse il prequel Human Revolution, la serie stava dunque per avere un seguito. Erano pronte due possibili sceneggiature: il gioco avrebbe raccontato una di queste due trame:
"La prima parla di un soldato Black Ops biomeccanico che si rende irreperibile dopo aver scoperto di essere stato usato con l'inganno. I suoi manipolatori lo rintracciano e minacciano di portarlo di fronte alla corte marziale, oltre che di attentare alla vita di sua moglie, a meno che lui non accetti un ultimo incarico. È interresante che le missioni avrebbero alternato flashback e nuovi avvenimenti", afferma Martin.
"La seconda storia inizia subito dopo la fine di Deus Ex, con la distruzione di tutte le comunicazioni globali. In questa trama si sarebbe investigato sul collasso, cercando di salvare la propria sorella da un culto emerso nella situazione di caos".